Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR44Q5JSH3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms