Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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