Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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