Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCRLQ16602 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms