Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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