Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms