Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms