Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEC23BQ15437 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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