Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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