Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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