Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms