Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAMB3Q13751 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms