Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms