Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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