Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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