Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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