Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms