Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EGR3Q06889 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms