Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRAMEF13-202ENST00000638454 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RAB37-212ENST00000528438 1494 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CASC9-201ENST00000504531 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC080079.1-201ENST00000509326 1045 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC137579.1-201ENST00000519978 836 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPP2R3C-213ENST00000555644 1347 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC01343-201ENST00000431311 2283 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms