Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms