Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms