Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms