Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGCXP38435 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GGCXP38435 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms