Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC245297.3-201ENST00000611769 838 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms