Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms