Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms