Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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