Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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