Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms