Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRFP10586 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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