Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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