Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RGPD3A6NKT7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGPD3A6NKT7 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms