Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A4Q9Y6R1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A4Q9Y6R1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms