Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIC4Q9Y696 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC4Q9Y696 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC4Q9Y696 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms