Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms