Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y661

HS3ST4, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST4Q9Y661 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS3ST4Q9Y661 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST4Q9Y661 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms