Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD2APQ9Y5K6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms