Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB12Q9Y5F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms