Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3Q9Y4A8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms