Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms