Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q5

LAMTOR2, Ragulator complex protein LAMTOR2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR2Q9Y2Q5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR2Q9Y2Q5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms