Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN8AQ9UQD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms