Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX6Q9UPM6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms