Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A4Q9UP95 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms