Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPIEQ9UNP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms