Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHTF1Q9UMS5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms