Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms