Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms