Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAV3Q9UKW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms