Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms